MatLabis kasutatakse koodi kirjutamisel kahte akent, programmeerimise aken ning käsuaken. Kui Command Windows (käsuaken) näha ei ole, siis saate selle lisada Layout nupu alt, Show >> Command History. Vahe seisneb selles, et programmeerimise aknas võib kirjutada mitu koodirida järjest ning lisada kommentaare. Tulemuste väljastamiseks vajutatakse rohelist nuppu RUN. Käsuaknasse kirjutatakse ühe koodirea kaupa ning tulemuste väljastamiseks tuleb vajutada ENTER. Töötamisel pole oluline, kuidas aknad paigutuvad. Paigutage need nii, nagu on mugav töötada. Näited mõlemast aknast on toodud järgnevalt:

3. Mitme faasi (aine oleku) importimine ühest sisendfailist
Käsuakna sisestatakse kood:
>> gas2 = Solution('diamond.yaml', 'gas');
Näitab, et faasiks on määratud gaas, solution meetod on alternatiivne viis, mida kasutatakse tulemuste väljastamiseks.
>> diamond = Solution('diamond.yaml','diamond');
Määrab teise faasi, tegemist on lahtise teemandiga.
>> diamonnd_surf = importInterface('diamond.yaml','diamond_100', gas2, diamond);
Mõlema faasi omavaheline interaktsioon. Diamond.yaml on sisendfail, kust võetakse informatsiooni faaside kohta, diamond_100 on imporditava reaktsiooni nimetus, gas2 on esimene faas ning diamond on teine faas.
Programmi poolt väljastatud tulemus:

Selleks, et kustutada kõik eeltoodud koodid, tuleb sisestada käsuaknas:
>> clear all
Esimene kood kustutab kõik objektid, mis olid loodud MatLabi poolt ning kood
>> cleanup
kustutab objekte, mis olid loodud Cantera poolt.